储存事项:
1.裂解液AP1低温时可能出现析出和沉淀,可以在65℃水浴几分钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。
2.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。
操作步骤:(实验前请先阅读注意事项)
1.取适量植物组织(新鲜组织100mg或干重组织20mg)在研钵中加入液氮充分碾磨成细粉。
2.转移细粉到一个1.5ml离心管,不要解冻,加入400ul缓冲液AP1和4ulRNaseA(10
mg/ml),旋涡振荡1分钟,充分混匀,室温放置10分钟。 注意:由于植物材料多样性非常显著,所取实验材料的最适量需根据材料的不同,或相同材料的不同组织等进行摸索。
如果组织裂解困难,可根据需要加一个轻柔匀浆10秒的步骤帮助裂解。大多数情况下不需要离心去除未完全裂解的组织,因为后面有一个离心去除的步骤。
3.65℃水浴10分钟,在水浴过程中颠倒离心管2-3次,混合样品。
4.加入130ul缓冲液AP2,涡旋振荡充分混匀,冰上放置5分钟,12,000rpm离心5-10分钟,小心吸取上清到一个新的1.5ml离心管,注意不要吸到界面物质。
5.可选步骤:为了去除上清液中的沉淀杂质,使提取基因组DNA纯度更高,可将上清液再次12,000rpm离心5分钟,小心吸取上清到一个干净的1.5ml离心管中。
6.计算上清量,加入0.7倍体积的异丙醇,充分混匀。此时会出现絮状基因组DNA。12,000rpm离心2分钟,弃上清。
7.沉淀加入700u170%乙醇漂洗,12,000rpm离心2分钟,弃上清。
8.加入700ul70%乙醇重复漂洗一次,12,000rpm离心2分钟,弃上清,倒置后在吸水纸上轻敲几下以控干残留乙醇,空气晾干沉淀几分钟。
注意DNA不要干燥过头,否则极其难溶,也不能残留太多乙醇,否则乙醇会抑制下游如PCR、酶切等反应。
9.加入适量TE溶解DNA沉淀,轻弹管壁混匀,可以放置在65℃温育30-60分钟(不要超过一小时),中间不时的轻弹管壁帮助重新水化DNA。
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