建设工程纠纷只能约定由建设工程所在地法院管辖，不能约定其他法院管辖。因为该纠纷属于不动产专属管辖范畴，依据《民事诉讼法》第三十三条规定，不动产纠纷由不动产所在地法院管辖。因此，建设工程施工合同纠纷当事人只能约定由建设工程所在地法院管辖，不得约定其他法院管辖。
法律分析
建设工程纠纷只能约定由不动产所在地（即建设工程所在地）法院管辖，不能约定其他法院管辖。因为“建设工程施工合同纠纷”划分到不动产专属管辖的范畴，《民事诉讼法》第三十三条规定：因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖。所以建设工程施工合同纠纷当事人，只能约定由不动产所在地即建设工程所在地法院管辖，不能约定其他法院管辖。
拓展延伸
建设工程合同中管辖权约定的有效性及法律适用
建设工程合同中的管辖权约定是指在合同中明确约定建设工程纠纷应由哪个法院进行管辖的规定。其有效性及法律适用性受到法律法规的制约。根据我国《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律规定，当事人可以通过合同自主约定管辖权，但需符合法律的基本原则和强制性规定。合同约定的管辖权应当符合合同自由原则、合同公平原则以及公共利益等法律原则。同时，合同约定的管辖权也需要考虑到实际操作的可行性和合理性。在具体适用时，需要综合考虑合同约定、法律规定和实际情况等因素。因此，建设工程合同中的管辖权约定的有效性及法律适用性需要根据具体情况进行综合分析和判断。
结语
根据我国《民事诉讼法》第三十三条规定，建设工程纠纷应由不动产所在地的法院管辖。因此，在建设工程施工合同中，当事人只能约定由不动产所在地即建设工程所在地的法院进行管辖，而不能约定其他法院的管辖权。合同约定的管辖权应遵循法律的基本原则和强制性规定，并综合考虑实际情况进行判断。因此，在建设工程合同中，合理而有效的管辖权约定是确保纠纷解决的重要保障。
法律依据
《中华人民共和国民事诉讼法》第三十三条
最高人民法院关于适用《中华人民共和国民事诉讼法》若干问题的解释第二十八条
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