国内开设生物医学工程的学校很多所，但是你会发现好多有趣现象---有的生物医学工程系挂在生命科学院下面，而有的和生物工程在一起，还有的是在电气工程学院，也有在材料学院，自然也有在医学院……我们还是从问题开始吧。Why?为什么这样呢。别急我们从源头开始。生物医学工程学与其他学科一样，其发展也是由科技、社会、经济诸因素所决定的。这个名词最早出现在美国。1958年在美国成立了国际医学电子学联合会，1965年该组织改称国际医学和生物工程联合会，后来成为国际生物医学工程学会。而国内1977年才创建，并且专业设置集中在“生物电子”（就是使用电子手段来结合生物设计传感器等）方面，大家可以查一查浙大和东南在生物工程建系过程中发现。浙大和东南的电子系都不弱，所以有的电子系教授也结合国际形势开始考虑另辟山头。早期的生物医学工程教师都是从电子系、自动化系等拉出来的。
但是中国慢慢的很多东西都一窝蜂，大跃进，一窝蜂，生物医学工程开始在大江南北的大学铺展开来。每个学校都要建立生物医学工程，但是条件有限怎么办？先办起来，于是我们就可以看到上面的挂靠在各种学院下面的有趣现象了。挂靠的学院不一样，自然侧重的方向不同。但是问题来了，这个专业可是工科、医学、生物的结合啊，所以要学工科的基础学科-数学、电子；还要学生物、学习化学，对了还要学习医学……那么问题来了，大家确实都很好学，但是每个人都是学神、学霸吗，本科四年的时间放在那里，多而不精是必然……所以好多从生物医学工程出来的人都是万金油，但是哪一方面也不精通，编程比不过计算机，硬件比不过自动化，生物比不过生物工程，医学肯定也不行。而且毕业出路在哪里呢？医院？大哥咱中国是要编制的，医学院的博士还排着队呢。医疗仪器公司？你只有去干销售的，不过这个确实挺赚钱的，前提是你要做销售的了。当然你也可以，而且是更多的人是选择读研究生，所以自己考虑吧。
那么国内来说东南、浙大是国内做生物医学工程最早的，排在前面，其中东南还成立一个学院。如果想走学术，做研究，国内我觉得首选还是东南比较好，他们还有全国唯一的7年制本硕连读生物医学工程专业。但是话又说回来了，一个专业需要连起来读7年，可见要学多少东西啊。但是国内这些生物医学工程方向跟国外偏重不太一样。应该说在美国一类是偏生物和医学，以生物化学等专业的为背景，也有少数学医的。第二类是偏工程方向的，跟电子、计算机、物理等有关的。但是国内真正做图形处理、仪器的较少，因为如果在计算机学院、仪科系、电子等系，更好招学生。大部分老师的背景都是材料、化工、药物、生物过来的，这样的背景加上较差学科优势好发文章，但是这样更偏重理论，跟企业联系就较少了。所以，选方向一定要选好了