hi!各位好久不见,小伙伴们的科研道路是否顺利。
我的导师告诉我要讲好故事,才能让人觉得生动有趣,所以我今天想用另外一种方式和大家分享今天发现的一个大玩意儿
进一步进入github上发现其作者是如下光头男(luispedro):
所以小伙伴们有细胞等图像处理的时候可以关注一下这个包,我在后期也会分享一些包的应用给大家。今天仅仅简答介绍一下。
Mahotas 是一个快速的视觉算法的Python包,其主要是用C++写成,速度甚至超过了numpy数组计算操作。
现在有如下算法:
- watershed
- convex points calculation
- hit & miss, thinning
- Zernike & Haralick, LBP, and TAS features
- Speeded-Up Robust Features(SURF), a form of local features.
- thresholding
- convolution
- Sobel edge detection
- spline interpolation
- SLIC super pixes
现在Mahotas有超过100种的图像程序处理功能和计算机视觉功能,且现在还在增加。
安装
言归正传我,我们简单介绍一下安装方法,最简单的安装方法就是使用conda安装,其中conda加强包(conda-forge)具有mahots
conda config --add channels
conda install mahotas
其他方法包括pip安装
pip install mahotas
不过还是建议用conda安装,是否安装成功仅需要import mahotas as mh
导入一下看一下是否报错即可
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