搜索
您的当前位置:首页正文

mahotas安装教程

来源:二三娱乐

hi!各位好久不见,小伙伴们的科研道路是否顺利。
我的导师告诉我要讲好故事,才能让人觉得生动有趣,所以我今天想用另外一种方式和大家分享今天发现的一个玩意儿

进一步进入github上发现其作者是如下光头男(luispedro):


所以小伙伴们有细胞等图像处理的时候可以关注一下这个包,我在后期也会分享一些包的应用给大家。今天仅仅简答介绍一下。

Mahotas 是一个快速的视觉算法的Python包,其主要是用C++写成,速度甚至超过了numpy数组计算操作。

现在有如下算法:

  • watershed
  • convex points calculation
  • hit & miss, thinning
  • Zernike & Haralick, LBP, and TAS features
  • Speeded-Up Robust Features(SURF), a form of local features.
  • thresholding
  • convolution
  • Sobel edge detection
  • spline interpolation
  • SLIC super pixes

现在Mahotas有超过100种的图像程序处理功能和计算机视觉功能,且现在还在增加。

安装

言归正传我,我们简单介绍一下安装方法,最简单的安装方法就是使用conda安装,其中conda加强包(conda-forge)具有mahots

conda config --add channels 
conda install mahotas

其他方法包括pip安装

pip install mahotas

不过还是建议用conda安装,是否安装成功仅需要import mahotas as mh导入一下看一下是否报错即可

更多原创精彩内容敬请关注生信杂谈

Top